Ustvarjalci akcijskih spektaklov "Podli fantje", "Armageddon" in "Transformerji" prinašajo nove zabavne avanture obešenjaških ninja želv Rafaela, Leonarda, Michelangela in Donatela, ki morajo znova reševati New York pred uničenjem. Njihov večni sovražnik Shredder, ki je ušel iz zapora, je iznašel način, kako lahko ustvari lastne mutante; poleg tega pa se nad mesto zgrnejo uničujoči robotski Nezemljani. Dodatne težave povzročajo nesoglasja med želvjimi brati, saj bi se s pomočjo Shredderjevega seruma lahko spremenili v navadne ljudi. K sreči se lahko zanesejo na modre nasvete podganjega učitelja Splinterja in na pomoč zveste prijateljice April.