Agent Ethan Hunt dobi nalogo odkriti in uničiti zalogo nevarnih, genetsko ustvarjenih bakterij, toda to biološko orožje si poskuša prilastiti tudi mednarodna teroristična mreža, pod vodstvom nekdanjega agenta Seana Ambrosa (Dougray Scott). Slednji je že uspel ukrasti zdravilo, tako da mu za ustrahovanje celotnega sveta manjka samo še bakterija. Ethanu na pomoč pri infiltraciji v teroristično skupino pomaga spretna tatica Nyah (Thandie Newton), njuno sodelovanje pa kmalu prestopi meje izključne profesionalnosti. Med divjimi zasledovalnimi akcijami, nevarnimi obračuni in drznimi podvigi, pa se Nyah okuži z bakterijo, zdravilo pa se seveda nahaja pri zlobnem Seanu. Ethan ima tako še en razlog več, da osebno obračuna s kriminalcem in poleg človeštva reši tudi svojo novo ljubezen. Toda svet vohunov je zelo nepredvidljiv in nikoli ne veš, kdo igra dvojno igro.